Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMCC1O94876 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCC1O94876 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMCC1O94876 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMCC1O94876 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMCC1O94876 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCC1O94876 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCC1O94876 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCC1O94876 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCC1O94876 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCC1O94876 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCC1O94876 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMCC1O94876 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms