Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
TRPM2O94759 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TRPM2O94759 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TRPM2O94759 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TRPM2O94759 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TRPM2O94759 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
TRPM2O94759 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TRPM2O94759 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
TRPM2O94759 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TRPM2O94759 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TRPM2O94759 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TRPM2O94759 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TRPM2O94759 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TRPM2O94759 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
TRPM2O94759 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TRPM2O94759 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TRPM2O94759 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TRPM2O94759 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TRPM2O94759 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TRPM2O94759 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRPM2O94759 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRPM2O94759 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRPM2O94759 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TRPM2O94759 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TRPM2O94759 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TRPM2O94759 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TRPM2O94759 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TRPM2O94759 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TRPM2O94759 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TRPM2O94759 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRPM2O94759 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRPM2O94759 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TRPM2O94759 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TRPM2O94759 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TRPM2O94759 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TRPM2O94759 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TRPM2O94759 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TRPM2O94759 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TRPM2O94759 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TRPM2O94759 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TRPM2O94759 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
TRPM2O94759 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
TRPM2O94759 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TRPM2O94759 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRPM2O94759 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRPM2O94759 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TRPM2O94759 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TRPM2O94759 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TRPM2O94759 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TRPM2O94759 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TRPM2O94759 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TRPM2O94759 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRPM2O94759 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRPM2O94759 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRPM2O94759 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRPM2O94759 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRPM2O94759 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TRPM2O94759 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
TRPM2O94759 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
TRPM2O94759 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TRPM2O94759 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TRPM2O94759 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
TRPM2O94759 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRPM2O94759 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TRPM2O94759 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TRPM2O94759 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
TRPM2O94759 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRPM2O94759 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TRPM2O94759 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TRPM2O94759 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TRPM2O94759 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TRPM2O94759 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
TRPM2O94759 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRPM2O94759 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRPM2O94759 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRPM2O94759 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
TRPM2O94759 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
TRPM2O94759 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
TRPM2O94759 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms