Protein–RNA interactions for Protein: O75934

BCAS2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS2O75934 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAS2O75934 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAS2O75934 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCAS2O75934 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCAS2O75934 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCAS2O75934 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAS2O75934 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAS2O75934 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAS2O75934 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAS2O75934 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAS2O75934 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS2O75934 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS2O75934 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS2O75934 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS2O75934 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS2O75934 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAS2O75934 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAS2O75934 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAS2O75934 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAS2O75934 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAS2O75934 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAS2O75934 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAS2O75934 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAS2O75934 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAS2O75934 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAS2O75934 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAS2O75934 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAS2O75934 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAS2O75934 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAS2O75934 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAS2O75934 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAS2O75934 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAS2O75934 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAS2O75934 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAS2O75934 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCAS2O75934 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS2O75934 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS2O75934 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS2O75934 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS2O75934 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAS2O75934 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAS2O75934 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAS2O75934 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAS2O75934 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAS2O75934 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAS2O75934 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAS2O75934 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAS2O75934 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAS2O75934 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAS2O75934 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAS2O75934 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAS2O75934 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAS2O75934 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAS2O75934 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAS2O75934 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAS2O75934 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAS2O75934 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAS2O75934 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAS2O75934 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAS2O75934 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAS2O75934 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BCAS2O75934 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAS2O75934 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAS2O75934 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAS2O75934 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAS2O75934 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAS2O75934 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAS2O75934 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAS2O75934 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAS2O75934 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAS2O75934 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAS2O75934 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAS2O75934 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAS2O75934 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAS2O75934 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAS2O75934 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAS2O75934 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAS2O75934 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAS2O75934 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAS2O75934 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms