Protein–RNA interactions for Protein: O75718

CRTAP, Cartilage-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAPO75718 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAPO75718 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTAPO75718 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTAPO75718 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTAPO75718 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTAPO75718 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTAPO75718 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTAPO75718 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTAPO75718 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRTAPO75718 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRTAPO75718 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRTAPO75718 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRTAPO75718 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRTAPO75718 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRTAPO75718 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAPO75718 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAPO75718 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAPO75718 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAPO75718 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAPO75718 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAPO75718 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAPO75718 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRTAPO75718 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRTAPO75718 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRTAPO75718 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRTAPO75718 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRTAPO75718 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CRTAPO75718 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CRTAPO75718 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRTAPO75718 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRTAPO75718 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRTAPO75718 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRTAPO75718 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRTAPO75718 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRTAPO75718 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRTAPO75718 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRTAPO75718 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRTAPO75718 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms