Protein–RNA interactions for Protein: O75688

PPM1B, Protein phosphatase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1BO75688 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1BO75688 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1BO75688 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1BO75688 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1BO75688 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1BO75688 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1BO75688 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1BO75688 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1BO75688 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1BO75688 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPM1BO75688 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPM1BO75688 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPM1BO75688 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPM1BO75688 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPM1BO75688 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms