Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NPM3O75607 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NPM3O75607 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NPM3O75607 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NPM3O75607 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NPM3O75607 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NPM3O75607 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NPM3O75607 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NPM3O75607 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NPM3O75607 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NPM3O75607 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NPM3O75607 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NPM3O75607 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NPM3O75607 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NPM3O75607 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPM3O75607 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPM3O75607 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPM3O75607 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPM3O75607 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPM3O75607 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
NPM3O75607 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NPM3O75607 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NPM3O75607 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NPM3O75607 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NPM3O75607 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
NPM3O75607 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NPM3O75607 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NPM3O75607 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NPM3O75607 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NPM3O75607 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NPM3O75607 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NPM3O75607 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NPM3O75607 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NPM3O75607 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NPM3O75607 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NPM3O75607 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NPM3O75607 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NPM3O75607 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NPM3O75607 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NPM3O75607 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NPM3O75607 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NPM3O75607 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NPM3O75607 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NPM3O75607 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NPM3O75607 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NPM3O75607 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NPM3O75607 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NPM3O75607 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
NPM3O75607 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NPM3O75607 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NPM3O75607 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NPM3O75607 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NPM3O75607 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NPM3O75607 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPM3O75607 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPM3O75607 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPM3O75607 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPM3O75607 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPM3O75607 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPM3O75607 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPM3O75607 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPM3O75607 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NPM3O75607 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NPM3O75607 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NPM3O75607 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NPM3O75607 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NPM3O75607 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NPM3O75607 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NPM3O75607 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NPM3O75607 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NPM3O75607 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NPM3O75607 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NPM3O75607 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NPM3O75607 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NPM3O75607 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NPM3O75607 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NPM3O75607 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NPM3O75607 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NPM3O75607 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NPM3O75607 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NPM3O75607 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NPM3O75607 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NPM3O75607 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NPM3O75607 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NPM3O75607 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NPM3O75607 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NPM3O75607 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NPM3O75607 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NPM3O75607 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NPM3O75607 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
NPM3O75607 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NPM3O75607 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NPM3O75607 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NPM3O75607 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NPM3O75607 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NPM3O75607 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NPM3O75607 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NPM3O75607 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NPM3O75607 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NPM3O75607 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms