Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF254O75437 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF254O75437 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF254O75437 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF254O75437 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF254O75437 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF254O75437 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF254O75437 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF254O75437 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF254O75437 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF254O75437 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF254O75437 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF254O75437 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF254O75437 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF254O75437 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF254O75437 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF254O75437 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF254O75437 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF254O75437 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF254O75437 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF254O75437 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF254O75437 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms