Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3BO75182 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIN3BO75182 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIN3BO75182 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIN3BO75182 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3BO75182 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIN3BO75182 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3BO75182 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3BO75182 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3BO75182 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3BO75182 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3BO75182 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIN3BO75182 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3BO75182 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3BO75182 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIN3BO75182 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIN3BO75182 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIN3BO75182 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIN3BO75182 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIN3BO75182 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIN3BO75182 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIN3BO75182 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIN3BO75182 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIN3BO75182 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIN3BO75182 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIN3BO75182 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3BO75182 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIN3BO75182 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3BO75182 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3BO75182 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIN3BO75182 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SIN3BO75182 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3BO75182 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3BO75182 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3BO75182 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3BO75182 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3BO75182 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3BO75182 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3BO75182 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3BO75182 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3BO75182 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3BO75182 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3BO75182 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3BO75182 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIN3BO75182 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIN3BO75182 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SIN3BO75182 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIN3BO75182 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIN3BO75182 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIN3BO75182 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SIN3BO75182 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SIN3BO75182 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SIN3BO75182 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIN3BO75182 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3BO75182 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3BO75182 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3BO75182 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3BO75182 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3BO75182 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3BO75182 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3BO75182 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIN3BO75182 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIN3BO75182 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIN3BO75182 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SIN3BO75182 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIN3BO75182 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIN3BO75182 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIN3BO75182 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIN3BO75182 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIN3BO75182 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIN3BO75182 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIN3BO75182 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIN3BO75182 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIN3BO75182 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIN3BO75182 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms