Protein–RNA interactions for Protein: O75146

HIP1R, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1RO75146 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HIP1RO75146 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIP1RO75146 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HIP1RO75146 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIP1RO75146 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HIP1RO75146 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIP1RO75146 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIP1RO75146 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIP1RO75146 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIP1RO75146 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIP1RO75146 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIP1RO75146 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
HIP1RO75146 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIP1RO75146 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIP1RO75146 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIP1RO75146 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIP1RO75146 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIP1RO75146 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HIP1RO75146 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIP1RO75146 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIP1RO75146 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIP1RO75146 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIP1RO75146 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIP1RO75146 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HIP1RO75146 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIP1RO75146 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIP1RO75146 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIP1RO75146 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIP1RO75146 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIP1RO75146 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIP1RO75146 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIP1RO75146 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIP1RO75146 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIP1RO75146 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIP1RO75146 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIP1RO75146 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIP1RO75146 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms