Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
COBLO75128 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
COBLO75128 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
COBLO75128 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
COBLO75128 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
COBLO75128 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
COBLO75128 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
COBLO75128 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
COBLO75128 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
COBLO75128 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
COBLO75128 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
COBLO75128 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
COBLO75128 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
COBLO75128 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
COBLO75128 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
COBLO75128 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
COBLO75128 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
COBLO75128 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
COBLO75128 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
COBLO75128 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
COBLO75128 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
COBLO75128 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
COBLO75128 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
COBLO75128 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
COBLO75128 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
COBLO75128 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
COBLO75128 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COBLO75128 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
COBLO75128 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COBLO75128 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
COBLO75128 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
COBLO75128 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COBLO75128 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
COBLO75128 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
COBLO75128 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
COBLO75128 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
COBLO75128 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
COBLO75128 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
COBLO75128 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
COBLO75128 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
COBLO75128 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
COBLO75128 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
COBLO75128 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
COBLO75128 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
COBLO75128 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
COBLO75128 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
COBLO75128 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
COBLO75128 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
COBLO75128 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
COBLO75128 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
COBLO75128 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
COBLO75128 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
COBLO75128 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
COBLO75128 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
COBLO75128 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
COBLO75128 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
COBLO75128 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
COBLO75128 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
COBLO75128 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
COBLO75128 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
COBLO75128 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
COBLO75128 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COBLO75128 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COBLO75128 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COBLO75128 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COBLO75128 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COBLO75128 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COBLO75128 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
COBLO75128 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COBLO75128 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COBLO75128 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COBLO75128 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COBLO75128 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COBLO75128 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COBLO75128 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COBLO75128 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COBLO75128 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COBLO75128 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COBLO75128 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COBLO75128 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
COBLO75128 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
COBLO75128 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COBLO75128 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COBLO75128 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COBLO75128 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COBLO75128 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COBLO75128 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COBLO75128 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COBLO75128 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COBLO75128 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COBLO75128 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COBLO75128 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COBLO75128 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
COBLO75128 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COBLO75128 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COBLO75128 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
COBLO75128 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
COBLO75128 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COBLO75128 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COBLO75128 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms