Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPX2O60687 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPX2O60687 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPX2O60687 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPX2O60687 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPX2O60687 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPX2O60687 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPX2O60687 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPX2O60687 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPX2O60687 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPX2O60687 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPX2O60687 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPX2O60687 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPX2O60687 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPX2O60687 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPX2O60687 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPX2O60687 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPX2O60687 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRPX2O60687 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRPX2O60687 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRPX2O60687 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRPX2O60687 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRPX2O60687 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRPX2O60687 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRPX2O60687 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRPX2O60687 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRPX2O60687 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPX2O60687 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPX2O60687 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms