Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP9O43818 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP9O43818 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP9O43818 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP9O43818 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP9O43818 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP9O43818 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP9O43818 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP9O43818 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP9O43818 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP9O43818 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP9O43818 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP9O43818 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP9O43818 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP9O43818 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP9O43818 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP9O43818 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP9O43818 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP9O43818 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP9O43818 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP9O43818 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP9O43818 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP9O43818 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP9O43818 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP9O43818 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP9O43818 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP9O43818 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP9O43818 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP9O43818 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP9O43818 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP9O43818 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP9O43818 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP9O43818 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP9O43818 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP9O43818 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP9O43818 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP9O43818 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP9O43818 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP9O43818 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP9O43818 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP9O43818 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP9O43818 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP9O43818 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP9O43818 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP9O43818 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP9O43818 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP9O43818 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP9O43818 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP9O43818 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP9O43818 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP9O43818 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP9O43818 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP9O43818 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP9O43818 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP9O43818 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP9O43818 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP9O43818 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP9O43818 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP9O43818 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP9O43818 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP9O43818 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP9O43818 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP9O43818 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP9O43818 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP9O43818 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP9O43818 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP9O43818 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP9O43818 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP9O43818 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP9O43818 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RRP9O43818 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RRP9O43818 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP9O43818 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP9O43818 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP9O43818 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP9O43818 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP9O43818 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP9O43818 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP9O43818 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP9O43818 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP9O43818 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP9O43818 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP9O43818 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP9O43818 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP9O43818 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP9O43818 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP9O43818 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP9O43818 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP9O43818 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP9O43818 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP9O43818 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RRP9O43818 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRP9O43818 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRP9O43818 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRP9O43818 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RRP9O43818 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RRP9O43818 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP9O43818 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP9O43818 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP9O43818 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms