Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNAB3O43448 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNAB3O43448 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNAB3O43448 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNAB3O43448 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms