Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTIFO43310 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTIFO43310 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTIFO43310 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTIFO43310 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTIFO43310 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTIFO43310 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTIFO43310 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTIFO43310 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTIFO43310 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTIFO43310 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTIFO43310 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTIFO43310 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTIFO43310 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTIFO43310 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTIFO43310 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTIFO43310 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTIFO43310 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTIFO43310 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTIFO43310 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTIFO43310 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTIFO43310 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTIFO43310 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTIFO43310 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTIFO43310 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTIFO43310 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTIFO43310 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTIFO43310 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTIFO43310 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTIFO43310 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTIFO43310 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTIFO43310 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTIFO43310 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTIFO43310 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTIFO43310 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTIFO43310 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTIFO43310 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTIFO43310 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTIFO43310 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTIFO43310 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTIFO43310 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTIFO43310 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CTIFO43310 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTIFO43310 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTIFO43310 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTIFO43310 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTIFO43310 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTIFO43310 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTIFO43310 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTIFO43310 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTIFO43310 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CTIFO43310 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTIFO43310 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTIFO43310 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTIFO43310 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTIFO43310 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTIFO43310 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTIFO43310 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTIFO43310 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTIFO43310 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CTIFO43310 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTIFO43310 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTIFO43310 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTIFO43310 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTIFO43310 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTIFO43310 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTIFO43310 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTIFO43310 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTIFO43310 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CTIFO43310 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CTIFO43310 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CTIFO43310 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTIFO43310 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTIFO43310 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTIFO43310 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTIFO43310 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTIFO43310 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTIFO43310 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTIFO43310 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTIFO43310 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTIFO43310 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTIFO43310 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTIFO43310 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CTIFO43310 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CTIFO43310 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTIFO43310 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTIFO43310 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTIFO43310 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTIFO43310 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTIFO43310 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTIFO43310 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTIFO43310 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTIFO43310 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTIFO43310 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTIFO43310 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTIFO43310 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTIFO43310 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTIFO43310 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTIFO43310 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTIFO43310 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms