Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SART1O43290 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SART1O43290 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SART1O43290 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SART1O43290 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SART1O43290 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SART1O43290 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SART1O43290 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SART1O43290 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SART1O43290 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SART1O43290 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SART1O43290 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SART1O43290 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SART1O43290 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SART1O43290 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SART1O43290 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SART1O43290 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SART1O43290 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SART1O43290 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SART1O43290 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SART1O43290 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SART1O43290 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SART1O43290 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SART1O43290 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SART1O43290 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SART1O43290 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SART1O43290 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SART1O43290 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SART1O43290 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SART1O43290 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SART1O43290 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SART1O43290 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SART1O43290 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SART1O43290 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SART1O43290 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SART1O43290 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SART1O43290 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SART1O43290 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SART1O43290 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SART1O43290 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SART1O43290 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SART1O43290 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SART1O43290 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SART1O43290 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SART1O43290 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SART1O43290 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SART1O43290 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SART1O43290 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SART1O43290 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SART1O43290 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SART1O43290 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SART1O43290 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SART1O43290 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SART1O43290 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SART1O43290 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SART1O43290 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SART1O43290 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SART1O43290 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SART1O43290 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SART1O43290 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SART1O43290 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SART1O43290 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SART1O43290 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SART1O43290 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SART1O43290 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SART1O43290 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SART1O43290 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SART1O43290 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SART1O43290 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SART1O43290 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SART1O43290 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SART1O43290 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SART1O43290 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SART1O43290 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SART1O43290 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SART1O43290 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SART1O43290 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SART1O43290 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SART1O43290 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SART1O43290 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SART1O43290 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SART1O43290 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SART1O43290 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SART1O43290 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SART1O43290 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SART1O43290 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SART1O43290 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SART1O43290 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SART1O43290 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SART1O43290 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SART1O43290 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SART1O43290 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SART1O43290 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SART1O43290 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SART1O43290 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SART1O43290 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SART1O43290 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SART1O43290 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SART1O43290 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SART1O43290 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms