Protein–RNA interactions for Protein: O43280

TREH, Trehalase, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREHO43280 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TREHO43280 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TREHO43280 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TREHO43280 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TREHO43280 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TREHO43280 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TREHO43280 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TREHO43280 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TREHO43280 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TREHO43280 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TREHO43280 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TREHO43280 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TREHO43280 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TREHO43280 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TREHO43280 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TREHO43280 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TREHO43280 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TREHO43280 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TREHO43280 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TREHO43280 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TREHO43280 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TREHO43280 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TREHO43280 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TREHO43280 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TREHO43280 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TREHO43280 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TREHO43280 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TREHO43280 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TREHO43280 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TREHO43280 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TREHO43280 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TREHO43280 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TREHO43280 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TREHO43280 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TREHO43280 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TREHO43280 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TREHO43280 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TREHO43280 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TREHO43280 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TREHO43280 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TREHO43280 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TREHO43280 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TREHO43280 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TREHO43280 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TREHO43280 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TREHO43280 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TREHO43280 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TREHO43280 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TREHO43280 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TREHO43280 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TREHO43280 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TREHO43280 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TREHO43280 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TREHO43280 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TREHO43280 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TREHO43280 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TREHO43280 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TREHO43280 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TREHO43280 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TREHO43280 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TREHO43280 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TREHO43280 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TREHO43280 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TREHO43280 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TREHO43280 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TREHO43280 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TREHO43280 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TREHO43280 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TREHO43280 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TREHO43280 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TREHO43280 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TREHO43280 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TREHO43280 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TREHO43280 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TREHO43280 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TREHO43280 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TREHO43280 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TREHO43280 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TREHO43280 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TREHO43280 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TREHO43280 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TREHO43280 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TREHO43280 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TREHO43280 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TREHO43280 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TREHO43280 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TREHO43280 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TREHO43280 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TREHO43280 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TREHO43280 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TREHO43280 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TREHO43280 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TREHO43280 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TREHO43280 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TREHO43280 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TREHO43280 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TREHO43280 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TREHO43280 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TREHO43280 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TREHO43280 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms