Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIAH2O43255 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SIAH2O43255 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIAH2O43255 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIAH2O43255 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIAH2O43255 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIAH2O43255 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIAH2O43255 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIAH2O43255 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIAH2O43255 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIAH2O43255 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIAH2O43255 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIAH2O43255 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIAH2O43255 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIAH2O43255 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIAH2O43255 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIAH2O43255 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIAH2O43255 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIAH2O43255 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIAH2O43255 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIAH2O43255 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIAH2O43255 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIAH2O43255 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIAH2O43255 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIAH2O43255 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIAH2O43255 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIAH2O43255 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIAH2O43255 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SIAH2O43255 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIAH2O43255 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIAH2O43255 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIAH2O43255 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIAH2O43255 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIAH2O43255 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIAH2O43255 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIAH2O43255 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIAH2O43255 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SIAH2O43255 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIAH2O43255 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIAH2O43255 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIAH2O43255 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIAH2O43255 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIAH2O43255 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIAH2O43255 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SIAH2O43255 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms