Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUPL2O15504 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NUPL2O15504 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NUPL2O15504 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUPL2O15504 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUPL2O15504 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUPL2O15504 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUPL2O15504 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUPL2O15504 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NUPL2O15504 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUPL2O15504 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUPL2O15504 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUPL2O15504 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUPL2O15504 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUPL2O15504 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUPL2O15504 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUPL2O15504 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUPL2O15504 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUPL2O15504 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUPL2O15504 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUPL2O15504 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUPL2O15504 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUPL2O15504 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUPL2O15504 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUPL2O15504 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUPL2O15504 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUPL2O15504 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUPL2O15504 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms