Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TO15178 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TO15178 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TO15178 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TO15178 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TO15178 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TO15178 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TO15178 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TO15178 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TO15178 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TO15178 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TO15178 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TO15178 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TO15178 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TO15178 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TO15178 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TO15178 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TO15178 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TO15178 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TO15178 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TO15178 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TO15178 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TO15178 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TO15178 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TO15178 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TO15178 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TO15178 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TO15178 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TO15178 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TO15178 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TO15178 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TO15178 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TO15178 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TO15178 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TO15178 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TO15178 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TO15178 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TO15178 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TO15178 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TO15178 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TO15178 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TO15178 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TO15178 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TO15178 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TO15178 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TO15178 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TO15178 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TO15178 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TO15178 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TO15178 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TO15178 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TO15178 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TO15178 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TO15178 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TO15178 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TO15178 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TO15178 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TO15178 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TO15178 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TO15178 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TO15178 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TO15178 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TO15178 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TO15178 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TO15178 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TO15178 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TO15178 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TO15178 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TO15178 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TO15178 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TO15178 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TO15178 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TO15178 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TO15178 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TO15178 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TO15178 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TO15178 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TO15178 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TO15178 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TO15178 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TO15178 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TO15178 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TO15178 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TO15178 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TO15178 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TO15178 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TO15178 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TO15178 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TO15178 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TO15178 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TO15178 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TO15178 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TO15178 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TO15178 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TO15178 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TO15178 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TO15178 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TO15178 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TO15178 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TO15178 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms