Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
POLR3AO14802 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
POLR3AO14802 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
POLR3AO14802 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
POLR3AO14802 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
POLR3AO14802 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
POLR3AO14802 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
POLR3AO14802 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
POLR3AO14802 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
POLR3AO14802 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
POLR3AO14802 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
POLR3AO14802 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
POLR3AO14802 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
POLR3AO14802 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
POLR3AO14802 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
POLR3AO14802 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
POLR3AO14802 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
POLR3AO14802 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
POLR3AO14802 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
POLR3AO14802 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLR3AO14802 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLR3AO14802 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLR3AO14802 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
POLR3AO14802 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
POLR3AO14802 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
POLR3AO14802 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
POLR3AO14802 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
POLR3AO14802 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
POLR3AO14802 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
POLR3AO14802 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLR3AO14802 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLR3AO14802 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLR3AO14802 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
POLR3AO14802 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
POLR3AO14802 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
POLR3AO14802 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
POLR3AO14802 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
POLR3AO14802 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
POLR3AO14802 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
POLR3AO14802 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
POLR3AO14802 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
POLR3AO14802 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
POLR3AO14802 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
POLR3AO14802 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
POLR3AO14802 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
POLR3AO14802 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
POLR3AO14802 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
POLR3AO14802 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
POLR3AO14802 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
POLR3AO14802 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
POLR3AO14802 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
POLR3AO14802 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
POLR3AO14802 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
POLR3AO14802 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
POLR3AO14802 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
POLR3AO14802 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
POLR3AO14802 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
POLR3AO14802 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
POLR3AO14802 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
POLR3AO14802 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
POLR3AO14802 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
POLR3AO14802 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
POLR3AO14802 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
POLR3AO14802 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
POLR3AO14802 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
POLR3AO14802 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
POLR3AO14802 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
POLR3AO14802 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
POLR3AO14802 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
POLR3AO14802 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
POLR3AO14802 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
POLR3AO14802 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
POLR3AO14802 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
POLR3AO14802 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
POLR3AO14802 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms