Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSP2O14595 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSP2O14595 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSP2O14595 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSP2O14595 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSP2O14595 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSP2O14595 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSP2O14595 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSP2O14595 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSP2O14595 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2O14595 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2O14595 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSP2O14595 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSP2O14595 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2O14595 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2O14595 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2O14595 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2O14595 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2O14595 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2O14595 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2O14595 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2O14595 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSP2O14595 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSP2O14595 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSP2O14595 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSP2O14595 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDSP2O14595 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSP2O14595 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSP2O14595 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2O14595 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2O14595 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2O14595 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2O14595 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2O14595 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2O14595 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSP2O14595 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSP2O14595 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSP2O14595 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSP2O14595 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSP2O14595 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSP2O14595 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSP2O14595 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSP2O14595 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSP2O14595 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSP2O14595 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTDSP2O14595 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSP2O14595 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms