Protein–RNA interactions for Protein: O00570

SOX1, Transcription factor SOX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX1O00570 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOX1O00570 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SOX1O00570 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SOX1O00570 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SOX1O00570 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SOX1O00570 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SOX1O00570 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SOX1O00570 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SOX1O00570 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOX1O00570 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOX1O00570 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOX1O00570 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SOX1O00570 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SOX1O00570 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SOX1O00570 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOX1O00570 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOX1O00570 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SOX1O00570 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SOX1O00570 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOX1O00570 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOX1O00570 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOX1O00570 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOX1O00570 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOX1O00570 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SOX1O00570 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SOX1O00570 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SOX1O00570 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SOX1O00570 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SOX1O00570 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX1O00570 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX1O00570 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX1O00570 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SOX1O00570 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SOX1O00570 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SOX1O00570 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SOX1O00570 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SOX1O00570 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SOX1O00570 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOX1O00570 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOX1O00570 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOX1O00570 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SOX1O00570 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SOX1O00570 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SOX1O00570 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOX1O00570 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOX1O00570 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SOX1O00570 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SOX1O00570 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SOX1O00570 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SOX1O00570 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SOX1O00570 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SOX1O00570 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SOX1O00570 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOX1O00570 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOX1O00570 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOX1O00570 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOX1O00570 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOX1O00570 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOX1O00570 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOX1O00570 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOX1O00570 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOX1O00570 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOX1O00570 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOX1O00570 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOX1O00570 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOX1O00570 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOX1O00570 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOX1O00570 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOX1O00570 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOX1O00570 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SOX1O00570 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOX1O00570 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SOX1O00570 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOX1O00570 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOX1O00570 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOX1O00570 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOX1O00570 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOX1O00570 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOX1O00570 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX1O00570 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX1O00570 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX1O00570 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX1O00570 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX1O00570 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX1O00570 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOX1O00570 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOX1O00570 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOX1O00570 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOX1O00570 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOX1O00570 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOX1O00570 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOX1O00570 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOX1O00570 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOX1O00570 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOX1O00570 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOX1O00570 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOX1O00570 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOX1O00570 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOX1O00570 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SOX1O00570 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms