Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX2-CTNND1H3BSU7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX2-CTNND1H3BSU7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMX2-CTNND1H3BSU7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX2-CTNND1H3BSU7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMX2-CTNND1H3BSU7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMX2-CTNND1H3BSU7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMX2-CTNND1H3BSU7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMX2-CTNND1H3BSU7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMX2-CTNND1H3BSU7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMX2-CTNND1H3BSU7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMX2-CTNND1H3BSU7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMX2-CTNND1H3BSU7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMX2-CTNND1H3BSU7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMX2-CTNND1H3BSU7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMX2-CTNND1H3BSU7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMX2-CTNND1H3BSU7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMX2-CTNND1H3BSU7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMX2-CTNND1H3BSU7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMX2-CTNND1H3BSU7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMX2-CTNND1H3BSU7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMX2-CTNND1H3BSU7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMX2-CTNND1H3BSU7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX2-CTNND1H3BSU7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX2-CTNND1H3BSU7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX2-CTNND1H3BSU7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX2-CTNND1H3BSU7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX2-CTNND1H3BSU7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX2-CTNND1H3BSU7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX2-CTNND1H3BSU7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX2-CTNND1H3BSU7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX2-CTNND1H3BSU7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX2-CTNND1H3BSU7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMX2-CTNND1H3BSU7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 843.6 ms