Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
H3BNC9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
H3BNC9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
H3BNC9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
H3BNC9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
H3BNC9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
H3BNC9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
H3BNC9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
H3BNC9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
H3BNC9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
H3BNC9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
H3BNC9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
H3BNC9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
H3BNC9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
H3BNC9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BNC9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BNC9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
H3BNC9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
H3BNC9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
H3BNC9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H3BNC9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H3BNC9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
H3BNC9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H3BNC9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
H3BNC9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
H3BNC9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
H3BNC9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BNC9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BNC9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BNC9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
H3BNC9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
H3BNC9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
H3BNC9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
H3BNC9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
H3BNC9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
H3BNC9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
H3BNC9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
H3BNC9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
H3BNC9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
H3BNC9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
H3BNC9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
H3BNC9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
H3BNC9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
H3BNC9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
H3BNC9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
H3BNC9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H3BNC9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
H3BNC9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
H3BNC9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
H3BNC9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
H3BNC9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
H3BNC9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
H3BNC9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H3BNC9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H3BNC9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BNC9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BNC9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BNC9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BNC9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BNC9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H3BNC9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H3BNC9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H3BNC9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
H3BNC9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
H3BNC9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
H3BNC9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
H3BNC9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
H3BNC9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
H3BNC9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
H3BNC9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
H3BNC9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
H3BNC9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
H3BNC9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
H3BNC9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
H3BNC9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
H3BNC9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
H3BNC9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
H3BNC9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
H3BNC9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
H3BNC9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H3BNC9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
H3BNC9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
H3BNC9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
H3BNC9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
H3BNC9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
H3BNC9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
H3BNC9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
H3BNC9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
H3BNC9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H3BNC9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H3BNC9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
H3BNC9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
H3BNC9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
H3BNC9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
H3BNC9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
H3BNC9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
H3BNC9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
H3BNC9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
H3BNC9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
H3BNC9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms