Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD8-MDP1E9PL57 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD8-MDP1E9PL57 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD8-MDP1E9PL57 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD8-MDP1E9PL57 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD8-MDP1E9PL57 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEDD8-MDP1E9PL57 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEDD8-MDP1E9PL57 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD8-MDP1E9PL57 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD8-MDP1E9PL57 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD8-MDP1E9PL57 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD8-MDP1E9PL57 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEDD8-MDP1E9PL57 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEDD8-MDP1E9PL57 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEDD8-MDP1E9PL57 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEDD8-MDP1E9PL57 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD8-MDP1E9PL57 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD8-MDP1E9PL57 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD8-MDP1E9PL57 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD8-MDP1E9PL57 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD8-MDP1E9PL57 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD8-MDP1E9PL57 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD8-MDP1E9PL57 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEDD8-MDP1E9PL57 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEDD8-MDP1E9PL57 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD8-MDP1E9PL57 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD8-MDP1E9PL57 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEDD8-MDP1E9PL57 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEDD8-MDP1E9PL57 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD8-MDP1E9PL57 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD8-MDP1E9PL57 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD8-MDP1E9PL57 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD8-MDP1E9PL57 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEDD8-MDP1E9PL57 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEDD8-MDP1E9PL57 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEDD8-MDP1E9PL57 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD8-MDP1E9PL57 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD8-MDP1E9PL57 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD8-MDP1E9PL57 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD8-MDP1E9PL57 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD8-MDP1E9PL57 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD8-MDP1E9PL57 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NEDD8-MDP1E9PL57 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1E9PL57 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1E9PL57 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1E9PL57 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1E9PL57 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1E9PL57 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1E9PL57 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD8-MDP1E9PL57 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms