Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms