Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDCB7Z8K6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDCB7Z8K6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDCB7Z8K6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDCB7Z8K6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDCB7Z8K6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDCB7Z8K6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRDCB7Z8K6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRDCB7Z8K6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDCB7Z8K6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDCB7Z8K6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDCB7Z8K6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms