Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBD1B2RD01 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBD1B2RD01 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBD1B2RD01 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBD1B2RD01 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBD1B2RD01 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBD1B2RD01 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBD1B2RD01 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBD1B2RD01 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBD1B2RD01 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBD1B2RD01 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBD1B2RD01 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBD1B2RD01 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBD1B2RD01 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBD1B2RD01 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBD1B2RD01 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBD1B2RD01 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPBD1B2RD01 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms