Protein–RNA interactions for Protein: A8MV72

Putative UPF0607 protein ENSP00000382826, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MV72 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A8MV72 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A8MV72 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A8MV72 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A8MV72 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A8MV72 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A8MV72 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
A8MV72 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A8MV72 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A8MV72 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A8MV72 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A8MV72 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A8MV72 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A8MV72 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A8MV72 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A8MV72 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A8MV72 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A8MV72 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A8MV72 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A8MV72 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A8MV72 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A8MV72 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A8MV72 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A8MV72 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A8MV72 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A8MV72 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A8MV72 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A8MV72 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A8MV72 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A8MV72 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A8MV72 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A8MV72 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A8MV72 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A8MV72 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A8MV72 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A8MV72 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A8MV72 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A8MV72 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A8MV72 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A8MV72 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A8MV72 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A8MV72 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A8MV72 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A8MV72 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A8MV72 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A8MV72 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A8MV72 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A8MV72 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A8MV72 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A8MV72 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A8MV72 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A8MV72 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A8MV72 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A8MV72 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A8MV72 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A8MV72 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A8MV72 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A8MV72 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A8MV72 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A8MV72 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A8MV72 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A8MV72 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A8MV72 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A8MV72 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A8MV72 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A8MV72 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A8MV72 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A8MV72 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A8MV72 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A8MV72 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A8MV72 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A8MV72 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A8MV72 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A8MV72 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A8MV72 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A8MV72 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MV72 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MV72 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MV72 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MV72 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MV72 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MV72 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A8MV72 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A8MV72 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MV72 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MV72 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MV72 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MV72 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MV72 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MV72 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A8MV72 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A8MV72 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A8MV72 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A8MV72 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A8MV72 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A8MV72 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A8MV72 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A8MV72 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A8MV72 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A8MV72 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms