Protein–RNA interactions for Protein: A8MV23

SERPINE3, Serpin E3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINE3A8MV23 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINE3A8MV23 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINE3A8MV23 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINE3A8MV23 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms