Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX4

SLC22A31, Putative solute carrier family 22 member 31, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A31A6NKX4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC22A31A6NKX4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC22A31A6NKX4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC22A31A6NKX4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC22A31A6NKX4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC22A31A6NKX4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A31A6NKX4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A31A6NKX4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A31A6NKX4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms