Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBAL3A6NHL2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBAL3A6NHL2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBAL3A6NHL2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBAL3A6NHL2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBAL3A6NHL2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBAL3A6NHL2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBAL3A6NHL2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBAL3A6NHL2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBAL3A6NHL2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBAL3A6NHL2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBAL3A6NHL2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBAL3A6NHL2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBAL3A6NHL2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBAL3A6NHL2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBAL3A6NHL2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBAL3A6NHL2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBAL3A6NHL2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBAL3A6NHL2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBAL3A6NHL2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBAL3A6NHL2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBAL3A6NHL2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBAL3A6NHL2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBAL3A6NHL2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBAL3A6NHL2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBAL3A6NHL2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBAL3A6NHL2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBAL3A6NHL2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBAL3A6NHL2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBAL3A6NHL2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBAL3A6NHL2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBAL3A6NHL2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBAL3A6NHL2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBAL3A6NHL2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBAL3A6NHL2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBAL3A6NHL2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBAL3A6NHL2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.8 ms