Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN9

ANKUB1, Protein ANKUB1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKUB1A6NFN9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKUB1A6NFN9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKUB1A6NFN9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKUB1A6NFN9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKUB1A6NFN9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKUB1A6NFN9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKUB1A6NFN9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKUB1A6NFN9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKUB1A6NFN9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKUB1A6NFN9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKUB1A6NFN9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKUB1A6NFN9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKUB1A6NFN9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKUB1A6NFN9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKUB1A6NFN9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKUB1A6NFN9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKUB1A6NFN9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKUB1A6NFN9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKUB1A6NFN9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ANKUB1A6NFN9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKUB1A6NFN9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ANKUB1A6NFN9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKUB1A6NFN9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKUB1A6NFN9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKUB1A6NFN9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKUB1A6NFN9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKUB1A6NFN9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKUB1A6NFN9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKUB1A6NFN9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKUB1A6NFN9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKUB1A6NFN9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKUB1A6NFN9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKUB1A6NFN9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKUB1A6NFN9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKUB1A6NFN9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKUB1A6NFN9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ANKUB1A6NFN9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ANKUB1A6NFN9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKUB1A6NFN9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKUB1A6NFN9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKUB1A6NFN9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKUB1A6NFN9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKUB1A6NFN9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKUB1A6NFN9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKUB1A6NFN9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKUB1A6NFN9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKUB1A6NFN9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms