Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PABPN1LA6NDY0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PABPN1LA6NDY0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PABPN1LA6NDY0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PABPN1LA6NDY0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PABPN1LA6NDY0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPN1LA6NDY0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPN1LA6NDY0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPN1LA6NDY0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPN1LA6NDY0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PABPN1LA6NDY0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PABPN1LA6NDY0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PABPN1LA6NDY0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PABPN1LA6NDY0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PABPN1LA6NDY0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PABPN1LA6NDY0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPN1LA6NDY0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PABPN1LA6NDY0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms