Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GMNCA6NCL1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GMNCA6NCL1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GMNCA6NCL1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GMNCA6NCL1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GMNCA6NCL1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GMNCA6NCL1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GMNCA6NCL1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GMNCA6NCL1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GMNCA6NCL1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GMNCA6NCL1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GMNCA6NCL1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GMNCA6NCL1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GMNCA6NCL1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GMNCA6NCL1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GMNCA6NCL1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GMNCA6NCL1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GMNCA6NCL1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GMNCA6NCL1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GMNCA6NCL1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GMNCA6NCL1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GMNCA6NCL1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GMNCA6NCL1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GMNCA6NCL1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GMNCA6NCL1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GMNCA6NCL1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GMNCA6NCL1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GMNCA6NCL1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GMNCA6NCL1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GMNCA6NCL1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GMNCA6NCL1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GMNCA6NCL1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GMNCA6NCL1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GMNCA6NCL1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GMNCA6NCL1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GMNCA6NCL1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GMNCA6NCL1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GMNCA6NCL1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GMNCA6NCL1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GMNCA6NCL1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GMNCA6NCL1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GMNCA6NCL1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GMNCA6NCL1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GMNCA6NCL1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GMNCA6NCL1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GMNCA6NCL1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GMNCA6NCL1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GMNCA6NCL1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GMNCA6NCL1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GMNCA6NCL1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GMNCA6NCL1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GMNCA6NCL1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GMNCA6NCL1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GMNCA6NCL1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GMNCA6NCL1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms