Protein–RNA interactions for Protein: A6NCK2

TRIM43B, Tripartite motif-containing protein 43B, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43BA6NCK2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM43BA6NCK2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM43BA6NCK2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM43BA6NCK2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM43BA6NCK2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM43BA6NCK2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM43BA6NCK2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM43BA6NCK2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM43BA6NCK2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM43BA6NCK2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM43BA6NCK2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM43BA6NCK2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM43BA6NCK2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM43BA6NCK2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM43BA6NCK2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM43BA6NCK2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM43BA6NCK2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM43BA6NCK2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM43BA6NCK2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM43BA6NCK2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM43BA6NCK2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM43BA6NCK2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM43BA6NCK2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM43BA6NCK2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM43BA6NCK2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM43BA6NCK2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM43BA6NCK2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM43BA6NCK2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM43BA6NCK2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM43BA6NCK2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM43BA6NCK2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM43BA6NCK2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM43BA6NCK2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM43BA6NCK2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM43BA6NCK2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM43BA6NCK2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM43BA6NCK2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM43BA6NCK2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM43BA6NCK2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM43BA6NCK2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM43BA6NCK2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM43BA6NCK2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM43BA6NCK2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM43BA6NCK2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM43BA6NCK2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM43BA6NCK2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM43BA6NCK2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM43BA6NCK2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM43BA6NCK2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM43BA6NCK2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM43BA6NCK2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM43BA6NCK2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM43BA6NCK2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM43BA6NCK2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM43BA6NCK2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM43BA6NCK2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM43BA6NCK2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM43BA6NCK2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM43BA6NCK2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM43BA6NCK2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM43BA6NCK2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM43BA6NCK2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM43BA6NCK2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM43BA6NCK2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM43BA6NCK2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM43BA6NCK2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM43BA6NCK2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM43BA6NCK2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM43BA6NCK2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM43BA6NCK2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM43BA6NCK2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM43BA6NCK2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM43BA6NCK2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM43BA6NCK2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM43BA6NCK2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM43BA6NCK2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM43BA6NCK2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM43BA6NCK2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM43BA6NCK2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM43BA6NCK2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms