Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPED1A4D0V7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPED1A4D0V7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPED1A4D0V7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPED1A4D0V7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPED1A4D0V7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPED1A4D0V7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPED1A4D0V7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPED1A4D0V7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPED1A4D0V7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPED1A4D0V7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPED1A4D0V7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPED1A4D0V7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPED1A4D0V7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPED1A4D0V7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPED1A4D0V7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPED1A4D0V7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPED1A4D0V7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPED1A4D0V7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPED1A4D0V7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPED1A4D0V7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPED1A4D0V7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPED1A4D0V7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPED1A4D0V7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPED1A4D0V7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPED1A4D0V7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CPED1A4D0V7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPED1A4D0V7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPED1A4D0V7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPED1A4D0V7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPED1A4D0V7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPED1A4D0V7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPED1A4D0V7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPED1A4D0V7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPED1A4D0V7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPED1A4D0V7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CPED1A4D0V7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPED1A4D0V7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPED1A4D0V7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPED1A4D0V7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPED1A4D0V7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPED1A4D0V7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPED1A4D0V7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPED1A4D0V7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPED1A4D0V7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPED1A4D0V7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPED1A4D0V7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPED1A4D0V7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPED1A4D0V7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPED1A4D0V7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPED1A4D0V7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CPED1A4D0V7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPED1A4D0V7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPED1A4D0V7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPED1A4D0V7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CPED1A4D0V7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPED1A4D0V7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPED1A4D0V7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms