Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
CCDC144AA2RUR9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC144AA2RUR9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC144AA2RUR9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CCDC144AA2RUR9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CCDC144AA2RUR9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CCDC144AA2RUR9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CCDC144AA2RUR9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC144AA2RUR9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC144AA2RUR9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC144AA2RUR9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC144AA2RUR9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC144AA2RUR9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC144AA2RUR9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC144AA2RUR9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC144AA2RUR9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CCDC144AA2RUR9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CCDC144AA2RUR9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC144AA2RUR9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC144AA2RUR9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC144AA2RUR9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC144AA2RUR9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC144AA2RUR9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC144AA2RUR9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC144AA2RUR9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC144AA2RUR9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC144AA2RUR9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC144AA2RUR9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC144AA2RUR9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC144AA2RUR9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CCDC144AA2RUR9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CCDC144AA2RUR9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC144AA2RUR9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC144AA2RUR9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC144AA2RUR9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC144AA2RUR9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CCDC144AA2RUR9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CCDC144AA2RUR9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CCDC144AA2RUR9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC144AA2RUR9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC144AA2RUR9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC144AA2RUR9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC144AA2RUR9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC144AA2RUR9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC144AA2RUR9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC144AA2RUR9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC144AA2RUR9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC144AA2RUR9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC144AA2RUR9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CCDC144AA2RUR9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CCDC144AA2RUR9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
CCDC144AA2RUR9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC144AA2RUR9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC144AA2RUR9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC144AA2RUR9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC144AA2RUR9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC144AA2RUR9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CCDC144AA2RUR9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC144AA2RUR9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC144AA2RUR9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC144AA2RUR9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC144AA2RUR9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
CCDC144AA2RUR9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CCDC144AA2RUR9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CCDC144AA2RUR9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC144AA2RUR9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC144AA2RUR9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC144AA2RUR9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC144AA2RUR9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC144AA2RUR9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC144AA2RUR9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC144AA2RUR9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC144AA2RUR9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC144AA2RUR9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC144AA2RUR9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CCDC144AA2RUR9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC144AA2RUR9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC144AA2RUR9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC144AA2RUR9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CCDC144AA2RUR9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CCDC144AA2RUR9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC144AA2RUR9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC144AA2RUR9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC144AA2RUR9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CCDC144AA2RUR9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CCDC144AA2RUR9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC144AA2RUR9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC144AA2RUR9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC144AA2RUR9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC144AA2RUR9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms