Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIPSLA2A3N6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIPSLA2A3N6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIPSLA2A3N6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIPSLA2A3N6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIPSLA2A3N6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIPSLA2A3N6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIPSLA2A3N6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIPSLA2A3N6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIPSLA2A3N6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIPSLA2A3N6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIPSLA2A3N6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIPSLA2A3N6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIPSLA2A3N6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIPSLA2A3N6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIPSLA2A3N6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIPSLA2A3N6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIPSLA2A3N6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIPSLA2A3N6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIPSLA2A3N6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIPSLA2A3N6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PIPSLA2A3N6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIPSLA2A3N6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIPSLA2A3N6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIPSLA2A3N6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIPSLA2A3N6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIPSLA2A3N6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIPSLA2A3N6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIPSLA2A3N6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIPSLA2A3N6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIPSLA2A3N6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIPSLA2A3N6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIPSLA2A3N6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIPSLA2A3N6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIPSLA2A3N6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIPSLA2A3N6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIPSLA2A3N6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIPSLA2A3N6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIPSLA2A3N6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIPSLA2A3N6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIPSLA2A3N6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms