Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQV1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0U1RQV1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0U1RQV1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RQV1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0U1RQV1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms