Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 FSTL5-203ENST00000427802 2920 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TNPO3-202ENST00000471166 3019 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RAB7B-202ENST00000617991 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RAD54L2-201ENST00000409535 9776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PDE6B-201ENST00000255622 3280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RBFOX1-203ENST00000355637 3321 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 DLGAP4-203ENST00000373907 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 C9orf85-206ENST00000486911 3321 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SEC14L6-201ENST00000402034 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ABHD4-203ENST00000428304 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 KAT7-202ENST00000424009 3469 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MATN2-208ENST00000520016 3495 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 NADK-204ENST00000378625 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CA13-201ENST00000321764 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 STEAP3-201ENST00000393106 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PPP1R12B-204ENST00000391959 15431 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CSNK1G1-201ENST00000303052 8179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02210-213ENST00000591271 9678 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 BLOC1S6-201ENST00000220531 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 NREP-201ENST00000257435 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RSL24D1-201ENST00000260443 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MINDY3-201ENST00000277632 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 N6AMT1-201ENST00000303775 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 WDR87-201ENST00000303868 8847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 OR1N1-201ENST00000304880 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC14-201ENST00000310351 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 OFCC1-201ENST00000316020 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 GANAB-202ENST00000356638 3608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ATG13-201ENST00000359513 4348 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TROVE2-201ENST00000367441 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ABCA4-201ENST00000370225 7309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 COL24A1-201ENST00000370571 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM35A-201ENST00000372930 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01291-201ENST00000377469 3662 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 FBXO18-202ENST00000379999 3702 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AL049775.1-201ENST00000380722 2448 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SNORA70I-201ENST00000384544 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF816-ZNF321P-201ENST00000391777 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RSPH10B2-203ENST00000404077 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RSPH10B-202ENST00000404406 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RPS7-204ENST00000407445 833 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 U3.31-201ENST00000408113 216 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 HMSD-201ENST00000408945 2101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CUL1-202ENST00000409469 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CHCHD2P5-201ENST00000421414 400 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 OR2L1P-201ENST00000422727 938 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01672-203ENST00000432429 1686 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC244505.2-201ENST00000435089 759 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CFAP61-210ENST00000451767 1946 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SYNPR-208ENST00000472899 527 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.9 ms