Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms