Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC6Q9UBN7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms