Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23BQ9NYZ1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms