Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms