Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms