Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIT2Q9NQR4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms