Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms