Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms