Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5DQ9BY66 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5DQ9BY66 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms